Да, многие ресурсы ведут себя капризно и их влияние взаимоуничтожает друг-друга. Полезных соединений и правда меньше, чем бесполезных.
Повышается количество ресурсов, исходя из этого можно достичь бОльших достижений, но и влияний на минусовые значения будет больше.
Если параметры разные, скажем минус к урону и - к рубящему, то естественно они будут вычитаться оба.

Система достаточно удачна, изменять её сейчас очень сложно - считайте, переделывать всё заново.

__________________
Молодость - недостаток, который быстро проходит.
Иоганн Вольфганг Гётте